Udział Katedry Genetyki WNB w badaniach genomu jądrowego buka zwyczajnego
Dr Bartosz Ulaszewski, dr Joanna Meger oraz prof. Jarosław Burczyk (PI) z Katedry Genetyki Wydziału Nauk Biologicznych, wraz z zespołami naukowców z Niemiec (PI: Marco Thines) i Francji (PI: Christophe Plomion), wzięli udział w badaniach zmierzających do szczegółowego opracowania genomu jądrowego buka zwyczajnego (Fagus sylvatica).
Obiektem badań było ponad 300-letnie drzewo buka (o imieniu Bhaga) rosnące w Parku Narodowym Kellerwald-Edersee (Niemcy), ale w badaniach wykorzystano również dane osobnika buka rosnącego w rezerwacie Jamy pod Grudziądzem.
Badania wykazały, że na genom jądrowy buka składa się ok. 541 milionów par zasad (pz), zorganizowanych w 12 chromosomów, o wielkościach od 28 do 73 mln par zasad. Zidentyfikowano ponad 60 tys. genów, a przeciętny gen miał długość ok. 4 tys. pz i składał się z ok. 5 eksonów. Co ciekawe, zaobserwowano liczne insercje fragmentów genomu mitochondrialnego i chloroplastowego do genomu jądrowego.
Opracowany genom buka będzie stanowił podstawę dalszych badań nad strukturą genomów roślinnych oraz pozwoli na zrozumienie procesów adaptacji gatunku do zmiennych warunków środowiska.
Szczegółowe wyniki badań opublikowano 8.02.2022 w czasopiśmie Frontiers in Genetics. DOI:10.3389/fgene.2021.691058
Drzewo buka zwyczajnego (o imieniu Bhaga, ponad 300-letnie), rosnące w Parku Narodowym Kellerwald-Edersee (Niemcy), dla którego opracowano szczegóły organizacji genomu jądrowego (fot. Marco Thines).